正常与性早熟中华绒螯蟹的Y-器官转录组分析

• 作者: 张佳鑫 张聪 徐敏杰 成永旭 杨志刚 杨筱珍 黄根勇
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中华绒螯蟹 性早熟 Y-器官 转录组
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 页码范围: 1667-1679
• 页数: 13页
• 分类号: Q785|S917.4
• 字数: 7185字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20161010568

摘要

性早熟是中华绒螯蟹养殖过程中普遍存在的一个问题.为发掘中华绒螯蟹性早熟相关的重要功能基因,实验采用Illumina Hiseq 2000高通量测序技术获得了正常与性早熟雌蟹的Y-器官转录组数据,并进行比较分析.结果显示,测序分别获得44619538和43052958个clean reads,比对发现2655个差异表达基因,Gene Ontology(GO)功能分类分析将文库中的差异表达基因归类到3大功能(生物过程、细胞组分和分子功能)的42个类别中.KEGG富集分析将文库中的差异表达基因富集到134条特定的KEGG代谢途径,其中4条是显著性富集,包括酮体合成和降解、丁酸甲酯代谢、神经营养因子信号通路和碱基切除修复通路.通过RNA-seq技术获得了丰富的中华绒螯蟹Y-器官转录组信息,为中华绒螯蟹新基因克隆、性早熟成因与预防和Y-器官的研究提供有价值的数据.