Proteomic profiling of early degenerative retina of RCS rats

• 作者: Fu, Yan Weng, Chuan-Huang Yin, Zheng-Qin Zhao, Cong-Jian Zhu, Zhi-Hong
• 来源期刊: 国际眼科杂志：英文版
• 学科: 医学
• 关键词: 网膜的退化 PROTEOMICS 线粒体 E2F1 MaxQuant RCS 老鼠
• 年，卷（期）: gjykzzywb_2017,（6）
• 页码范围: 878-889
• 页数: 12页
• 分类号: R77

摘要

为了在视网膜炎 pigmentosa (RP ) 识别内在的细胞、分子的变化，与它是更简单的过程更经济、在于的优点， .METHODSLabel 免费的基于 quantification 的 proteomics 分析与在现代生物研究增加频率被使用了。Dystrophic RCS 老鼠，为 RP 的学习的第一个实验室动物模型，与疾病作为人拥有一堂类似的病理学的功课。因此，我们为通过线性陷井四极从 dystrophic RCS 老鼠和 non-dystrophic congenic 控制视网膜介绍的深入的 proteome 采用了一条比较 proteomics 分析途径 - orbitrap MS/MS，表示了蛋白质(DEP ) 识别重要差别。生物信息学分析，包括基因本体论(去) 并且基因和染色体(KEGG ) 的京都百科全书小径注解和在上游的规章的分析，然后在这些视网膜蛋白质上被执行。最后，一个西方的弄污实验被执行在许多抄本因素 E2F1.RESULTSIn 验证差别这研究，我们从 RCS 老鼠和 non-dystrophic congenic 控制的网膜的蛋白质样品识别了 2375 个蛋白质组的一个总数。434 显著地， DEP 被学生 t 测试选择。基于生物信息学分析的结果，当在早网膜的退化 process.CONCLUSIONWe 的关键开始因素证明 mitochondrial 机能障碍和抄写因素 E2F1 实质地贡献 RP 的疾病病原学，我们识别了 mitochondrial 机能障碍和抄写因素 E2F1。结果为这网膜的退化疾病提供一条新潜在的治疗学的途径。