低温胁迫下杜鹃杂交后代优良株系的转录组分析

• 作者: 何静雯 卢丹 吴月燕 吴燕燕 明萌 沈梓力 谢晓鸿 邱甜
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杜鹃 低温胁迫 转录组 抗寒基因
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 页码范围: 52-60
• 页数: 9页
• 分类号: S685.21|Q78
• 字数: 5384字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2017.05.009

摘要

为探索杜鹃抗寒的分子机制,筛选抗寒相关基因,利用人工模拟低温,以杜鹃杂交后代优良株系繁景-6℃(T)处理和25℃(CK)对照为试验材料,进行转录组测序和数据从头组装及生物信息学分析,通过组装得到Unigenes序列122654个,功能注释结果显示,有大量Unigenes可以注释到基因本体(GO)和蛋白质直系同源数据库(COG)等数据库上,部分Unigenes无匹配信息,可能为杜鹃特有的基因序列.按GO功能分类,繁景杜鹃中的Uni-genes分为细胞组分、分子功能以及生物学过程3类,包括51个分支,其中有大量的Unigenes与代谢进程、催化活性和细胞进程相关.上调差异表达基因有6347个,下调差异表达基因4482个.通过对转录结果中差异表达显著的4个转录因子家族中的24个基因,其中,上调12个,下调12个,在低温胁迫下的表达水平验证,发现其与转录结果基本一致,证明该转录组数据可靠.