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玉米穗粗性状的全基因组关联分析及QTL元分析
玉米穗粗性状的全基因组关联分析及QTL元分析
作者:
宋希云
潘顺祥
赵美爱
邵晓宇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
玉米
穗粗
全基因组关联分析
元分析
摘要:
玉米(Zea mays)是全世界总产量最高的粮食作物,穗粗是玉米单株产量的重要指标.利用FarmCPU软件对292份玉米自交系进行全基因组关联分析(GWAS),筛选到28个显著性单核苷酸多态性(SNP)位点.借助IBM22008 Neighbors高密度图谱整合了2007~2015年文献发表的105个玉米穗粗性状的数量性状基因座(QTL),采用元分析的方法,确定了10个与穗粗相关的"一致性"QTL(Meta-QTL).通过查询各年各点最显著的SNP位点,以及位于Meta-QTL内的显著性SNP位点,获得了9个玉米穗粗的候选基因,分别位于玉米染色体区段bin 1.10、3.09、4.08、5.05、6.07、8.03、9.05、10.04.全基因组关联分析和Meta-QTL筛选的穗粗候选基因可以为玉米分子标记辅助育种和基因克隆提供有用的信息.本研究对玉米穗粗性状的遗传改良及高产稳产育种提供参考.
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玉米穗粗性状的全基因组关联分析及QTL元分析
来源期刊
植物生理学报
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关键词
玉米
穗粗
全基因组关联分析
元分析
年,卷(期)
2017,(12)
所属期刊栏目
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研究方向
页码范围
2091-2102
页数
12页
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语种
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宋希云
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邵晓宇
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植物生理学报
主办单位:
中国植物生理学会
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1108
CN:
31-2055/Q
开本:
大16开
出版地:
上海市岳阳路319号31B楼
邮发代号:
4-267
创刊时间:
1951
语种:
chi
出版文献量(篇)
5646
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4
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