大熊猫肠道放线菌的种群组成及多样性分析

• 作者: 张琪 张金羽 李倜 李德生 李静 赵珂 黄治
• 来源期刊: 微生物学通报
• 关键词: 大熊猫 肠道放线菌 多样性 变性梯度凝胶电泳
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 农业微生物
• 页码范围: 1138-1148
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13344/j.microbiol.china.160477

摘要

[目的]探究不同年龄、不同性别大熊猫肠道放线菌的多样性及群落结构,为寻找潜在产生活性化合物的放线菌资源提供理论依据.[方法]采用PCR-DGGE技术对大熊猫肠道放线菌进行分析,对电泳结果进行UPGMA聚类分析、主成分分析、生物多样性等多重比较.[结果]变性梯度凝胶电泳(DGGE)图谱显示,不同大熊猫肠道中放线菌的多样性及群落结构存在明显差异.随着年龄的增长,雌性大熊猫肠道中放线菌的多样性指数(H')和丰富度(S)逐渐减少,而雄性大熊猫肠道内放线菌的多样性指数(H')和丰富度(S)逐渐增多.不同个体的大熊猫肠道放线菌的群落结构存在明显差异,但相同性别之间的相似性很高.DGGE条带回收测序结果表明,获得的28条序列归属于10个放线菌属,其中链霉菌属(Streptomyces)为优势菌属,占总数的46％;北里孢菌属(Kitasatospora)、红球菌属(Rhodococcus)、棒杆菌属(Corynebacterium)、迪茨氏菌属(Dietziaceae)、大理石雕菌属(Marmoricola)、布登堡菌属(Beutenbergia)、微杆菌属(Microbacterium)、链嗜酸菌属(Streptacidiphilus)和芽生球菌属(Blastococcus)等为非链霉菌属,占总数的54％.[结论]大熊猫肠道内蕴藏着丰富的放线菌资源,其肠道菌群的结构与组成受年龄和性别的影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李静	四川农业大学资源学院	37	454	12.0	20.0
2	张金羽	四川农业大学资源学院	3	9	2.0	3.0
3	赵珂	四川农业大学资源学院	24	140	7.0	10.0
4	张琪	四川农业大学资源学院	4	9	2.0	3.0