应用化合物-靶点网络预测杜仲延缓软骨退变的药效物质基础及作用机制

• 作者: 付长龙 刘献祥 叶蕻芝 吴广文 李西海 林洁 郑春松
• 来源期刊: 中医正骨
• 关键词: 杜仲 骨关节炎 软骨,关节 化合物-靶点网络 药理作用分子作用机制 计算机模拟
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 6-10,18
• 页数: 6页
• 字数: 4385字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-6015.2017.12.002

摘要

目的:探讨杜仲延缓软骨退变的药效物质基础及作用机制.方法:通过检索北京大学天然产物库,检索出杜仲中的化合物117个,在Discovery studio模拟平台上建立杜仲化合物分子数据集.通过检索TTD数据库和相关文献,确定白细胞介素(interleukin,IL)-1β、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMP)-1、MMP-3、转化生长因子(transforming growth factor,TGF)-β1及聚蛋白多糖酶(a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs,ADAMTS)-4为杜仲延缓软骨退变的研究靶点,从RCSB蛋白数据库下载其蛋白质-配体复合物结构,在Discovery studio模拟平台上建立其蛋白分子数据集.利用分子对接和生物网络技术,构建杜仲化合物-软骨退变靶点作用网络,分析杜仲化合物与软骨退变靶点的作用情况,辨识杜仲延缓软骨退变的药效物质基础,并从杜仲化合物作用的靶点功能探讨杜仲延缓软骨退变的作用机制.结果:从杜仲化合物分子数据集中共筛选出70个化合物为杜仲延缓软骨退变的药效物质基础,分别属于环烯醚萜类、黄酮类和苯丙素类化合物.建立的杜仲化合物-软骨退变靶点作用网络中共有76个节点(包含70个杜仲化合物节点和6个靶点节点)和200条边,每个靶点的平均化合物数目为14个,平均每个化合物能与2.9个靶点作用.IL-1β、MMP-1、TNF-α、MMP-3、ADAMTS-4、TGF-β1、UNPD197620(环烯醚萜类化合物)、UNPD20544(环烯醚萜类化合物)、UNPD197619(环烯醚萜类化合物)、UNPD156594(环烯醚萜类化合物)、UNPD67874(黄酮类化合物)、UNPD117238(黄酮类化合物)和UNPD182417(环烯醚萜类化合物)具有较高的度和介数值.结论:杜仲延缓软骨退变的主要药效物质基础为环烯醚萜类和黄酮类化合物,其作用机制可能是通过抑制软骨中IL-1β、TNF-α的表达来减少软骨中MMPs和ADAMTS的表达,同时促进TGF-β1的表达,从而减少软骨破坏、促进软骨修复,最终延缓软骨退变的进程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶蕻芝		115	1200	20.0	26.0
2	刘献祥		180	3130	30.0	47.0
3	郑春松		57	580	13.0	21.0
4	李西海		15	169	8.0	12.0
5	吴广文		21	156	6.0	12.0
6	林洁		40	134	7.0	9.0
7	付长龙		30	201	9.0	12.0