以位置特异性得分矩阵和基因本体为特征的蛋白质亚细胞定位预测

• 作者: 刘冰静 郭红
• 来源期刊: 福州大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 定位预测 蛋白质亚细胞 位置特异性得分矩阵 基因本体 多标签分类
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 页码范围: 16-24
• 页数: 9页
• 分类号: TP399
• 字数: 8660字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7631/issn.1000-2243.2017.01.0016

摘要

提出一种蛋白质亚细胞定位预测方法.该方法以位置特异性得分矩阵和基因本体抽取对应特征,结合支持向量机构建多标签分类模型.充分考虑了蛋白质进化信息对其亚细胞定位的影响,并基于文本分类中涉及到的卡方检验的对数变换思想,构建基因本体注释信息的加权系数对其进行加权处理,从而提高预测的准确率.采用支持向量机作为基分类器构建多标签分类模型,进一步提高预测的准确率.通过在目前该领域两个常用的真实数据集上进行的一系列测试结果表明,该方法能有效提高蛋白质亚细胞定位预测的准确率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭红	福州大学数学与计算机科学学院	44	244	8.0	14.0
2	刘冰静	福州大学数学与计算机科学学院	1	3	1.0	1.0