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绿色杜氏藻香叶基焦磷酸合成酶基因(GPS)生物信息学与诱导表达分析
绿色杜氏藻香叶基焦磷酸合成酶基因(GPS)生物信息学与诱导表达分析
作者:
刘浩
周静
朱帅旗
王何瑜
马颖瑞
龚一富
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
绿色杜氏藻
GPS基因
生物信息学
类胡萝卜素
摘要:
香叶基焦磷酸合成酶(GPS)在植物体内催化二甲烯丙基焦磷酸与异戊烯基焦磷酸结合成萜类化合物前香叶基香叶基焦磷酸(GPP).为深入理解GPS蛋白在类胡萝卜素生物合成过程中的作用,本研究采用高通量测序方法获得绿色杜氏藻GPS基因(GenBank序号:KT751181)cDNA全长序列,并研究乙酰水杨酸(ASA)、硫酸铈铵(CAS)和花生四烯酸(AA)3种诱导子对绿色杜氏藻GPS基因表达的影响.测序结果表明,绿色杜氏藻GPS基因cDNA全长2 281 bp,开放阅读框为l 449 bp,编码463个氨基酸.绿色杜氏藻GPS蛋白的分子量为53 714.9,理论等电点(pI)为6.66,该蛋白分子呈亲水性,无信号肽和跨膜结构域.二级结构分析显示,该蛋白分子中螺旋结构占主导地位,占47.7%.系统进化树结果表明,绿色杜氏藻GPS蛋白与莱茵衣藻亲缘关系最相近.诱导表达分析显示,62.5 mg·L-1AA、0.2~0.8 mg·L-1ACS和10 mg·L-1 ASA可极显著提高绿色杜氏藻GPS基因表达;同时,类胡萝卜素含量也极显著升高,这一结果表明GPS基因与类胡萝卜素合成有关,GPS基因可能通过控制GPP的去向,间接影响绿色杜氏藻类胡萝卜素合成.本研究结果为揭示藻类类胡萝卜素合成机理及利用代谢工程策略提高类胡萝卜素含量奠定了理论基础.
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文献信息
篇名
绿色杜氏藻香叶基焦磷酸合成酶基因(GPS)生物信息学与诱导表达分析
来源期刊
核农学报
学科
关键词
绿色杜氏藻
GPS基因
生物信息学
类胡萝卜素
年,卷(期)
2017,(2)
所属期刊栏目
植物诱变育种·农业生物技术
研究方向
页码范围
248-254
页数
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.11869/j.issn.100-8551.2017.02.0248
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
龚一富
宁波大学海洋学院
54
342
11.0
16.0
2
朱帅旗
宁波大学海洋学院
17
79
4.0
8.0
3
刘浩
宁波大学海洋学院
9
46
3.0
6.0
4
王何瑜
宁波大学海洋学院
29
117
5.0
9.0
5
马颖瑞
宁波大学海洋学院
2
6
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2.0
6
周静
宁波大学海洋学院
3
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传播情况
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GPS基因
生物信息学
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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核农学报
主办单位:
中国原子能农学会
中国农业科学院农产品加工研究所(前中国农业科学院原子能利用研究所)
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-8551
CN:
11-2265/S
开本:
16开
出版地:
北京市海淀区圆明园西路2号农产品加工研究所
邮发代号:
创刊时间:
1987
语种:
chi
出版文献量(篇)
4988
总下载数(次)
6
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55367
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