16SrDNA克隆文库法分析拜城油鸡盲肠细菌多样性研究

• 作者: 刘利林 格明古丽·木哈台 王永 陈荣
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 拜城油鸡 盲肠 细菌 16SrDNA 多样性
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 18-21
• 页数: 4页
• 分类号: S811.5
• 字数: 3115字
• 语种: 中文

摘要

为了研究拜城油鸡盲肠细菌物种多样性,本研究采用基于16SrDNA基因序列系统发育分析的免培养方法进行细菌物种多样性分析,以盲肠内容物样品总DNA为模板,利用细菌通用引物扩增16SrDNA基因,构建16SrDNA基因克隆文库,并对文库中的插入序列进行RFLP分析.结果表明:随机挑选的252个克隆为阳性克隆,阳性率为65.7％,经过RFLP筛选出95个不同图谱的重组克隆并测序,比对分析后发现:拜城油鸡盲肠细菌分属于厚壁菌门(Firmicutes)(65.26％)、拟杆菌门(Bacteroidetes)27.37％)和变形菌门(Proteobacteria) (4.21％).在纲水平有梭菌纲(Clostridia)、拟杆菌纲(Bacteroidia)和ε变形菌纲(Epsilonproteobacteria)相对含量最多,分别占总菌的64.21％、26.32％和4.21.在科水平上以瘤胃菌科(Ruminococcaceae) (21.05％)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)(20％)和理研菌科(Rikenellaceae) (12.63％)相对含量最多,为优势科.在属水平上仅有31.58％的序列可以鉴定到属,Lachnoclostridium的相对含量最多,占总菌的12.63％,其次为另枝菌属(Alistipes)和瘤胃梭菌属(Ruminiclostridium).拜城油鸡盲肠内容物中的细菌组成具有丰富的多样性,并有新细菌分类单位的潜在资源,值得进一步进行开发研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王永	塔里木大学动物科学学院	43	49	4.0	5.0
2	陈荣	塔里木大学动物科学学院	23	49	4.0	6.0
3	刘利林	塔里木大学动物科学学院	20	61	4.0	7.0
4	格明古丽·木哈台	塔里木大学动物科学学院	7	14	2.0	3.0