上海郊区牛病毒性腹泻病毒(BVDV)基因型分析

• 作者: 于瑞嵩 冯蒙 李震 缪德年 董世娟 谢春芳 陈冰清
• 来源期刊: 上海农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牛病毒性腹泻病毒 基因型 同源性 重组分析
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医
• 页码范围: 119-123
• 页数: 5页
• 分类号: S852.65
• 字数: 3193字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15955/j.issn1000-3924.2017.03.23

摘要

采用RT-PCR方法对2014年在上海郊区某奶牛场分离得到的牛病毒性腹泻病毒(BVDV SHYB)进行基因组5'UTR、Npro和E2基因扩增,并对PCR产物进行克隆、测序和BLAST比对分析,构建系统进化树和进行SimPlot重组分析.结果表明:2014年上海郊区奶牛场感染的BVDV 5'UTR保守序列与猪源性BVDV-1m亚型的ZM-95病毒株高度同源,属BVDV-1m基因亚型,命名为BVDV-1 SHYB;紧接着BVDV-1SHYB病毒株5'UTR序列后面的Npro基因与BVDV-1b亚型病毒株同源性高,在5'UTR基因的3’端与Npro基因连接处有基因重组位点.