浙贝母肌动蛋白基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 俞信光 冯亚斌 施鑫磊 江建铭 沈晓霞 王忠华
• 来源期刊: 中成药
• 学科: 医学
• 关键词: 浙贝母 肌动蛋白(Actin)基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 成分分析
• 页码范围: 126-130
• 页数: 5页
• 分类号: R282
• 字数: 3759字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-1528.2017.01.025

摘要

目的 克隆浙贝母Fritillaria thunbergii Miq.肌动蛋白(Actin)基因,并进行生物信息学分析.方法 提取浙贝母根、茎、叶、花、鳞茎总RNA,设计合成简并引物.以叶片总RNA为模板,通过RT-PCR和Ta克隆技术克隆Actin基因保守区序列片段.以该基因为内参基因,对3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因进行组织特异性表达分析.结果 经RT-PCR扩增和Ta克隆,得到1段基因序列(463 bp).浙贝母Actin基因与岷江百合、郁金香、虎眼万年青、铁皮石斛、柿子、光皮桦、玉米相似度较高(84％～98％),其氨基酸序列与阿帝露茅膏菜、甘蓝型油菜、香草兰、岷江百合、麻疯树、枸杞、红海榄的同源性均在89％以上,并且其Actin蛋白与百脉根、岷江百合、郁金香亲缘关系较近.HMGR基因在该植物各部位表达有显著差异,依次为鳞茎＞花＞叶＞茎＞根.结论 首次从浙贝母中克隆出Actin基因(命名为FtActin),可为其有效利用奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王忠华	浙江万里学院生物技术研究所	103	874	15.0	24.0
2	江建铭		24	120	6.0	9.0
3	沈晓霞		50	403	10.0	18.0
4	俞信光	浙江万里学院生物技术研究所	12	113	4.0	10.0
5	冯亚斌	浙江万里学院生物技术研究所	11	53	4.0	7.0
6	施鑫磊	浙江万里学院生物技术研究所	1	1	1.0	1.0