兰花eIF5A基因家族鉴定与生物信息学分析

• 作者: 张杰伟 汤久杨 王宁琳 王宏芝 陈兰芬 魏建华
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 兰花 eIF5A 基因家族 进化分析
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 1218-1223
• 页数: 6页
• 分类号: S682
• 字数: 3944字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.011.010

摘要

为了系统分析兰花真核翻译起始因子5A (Eukaryotic translation initiation factor 5A,eIF5A)基因家族在兰花中如何发挥作用,利用兰花基因组数据库,通过生物信息学的方法,鉴定兰花eIF5A基因家族的基因结构、编码蛋白和磷酸化位点预测,通过序列比对进行进化分析.结果表明,兰花eIF5A基因家族含有eIF5A1和eIF5A2两个基因,分别含有5个和6个外显子.MEME保守基序分析显示,兰花eIF5A1和eIF5A2蛋白均含有1个保守的DNA结合寡核苷酸结合结构域(PF01287).磷酸化位点预测分析表明兰花eIF5A1和eIF5A2蛋白均含有大量的潜在磷酸化位点.以上结果将为今后揭示兰花eIF5A1和eIF5A2蛋白的功能提供重要的线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈兰芬		24	100	6.0	9.0
2	王宁琳		5	3	1.0	1.0
3	汤久杨		11	25	4.0	5.0