中国6个地区东方田鼠线粒体全基因组的比较与多态性位点的发掘

• 作者: 倪丽菊 周宇荀 孙凤萍 李凯 肖君华 高骏
• 来源期刊: 上海农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 东方田鼠 线粒体基因组 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医
• 页码范围: 114-118
• 页数: 5页
• 分类号: Q959.83
• 字数: 3672字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15955/j.issn1000-3924.2017.03.22

摘要

设计16对引物,完成了我国6个地区东方田鼠样本线粒体全基因组的扩增和测序拼接.结果表明:东方田鼠的线粒体全基因组长度为16 303-16 312 bp.利用线粒体全基因组构建的系统进化树表明,在我国分布的东方田鼠分为3个主要的分支:广西样本、宁夏指名亚种为代表的北方样本(包括宁夏、黑龙江、吉林)、湖南长江亚种为代表的湖南福建样本.对中国6个地区84个东方田鼠野生样本的线粒体上的细胞色素b基因(cyt b)进行重测序,并与其他亚洲近缘田鼠的同源序列比对,共发现13个东方田鼠特有的SNP位点.在线粒体基因组的结构上发现南方样本(广西、湖南、福建)与北方样本(宁夏、黑龙江、吉林)在线粒体基因组轻链复制区(OL区)的二级结构颈环上有一个3碱基(CCC-TTT)的突变.这些多态性位点可以作为今后东方田鼠样本鉴别、遗传多样性研究的重要分子遗传标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖君华	东华大学化学化工与生物工程学院	58	137	7.0	9.0
2	倪丽菊		8	10	2.0	3.0
3	李凯	东华大学化学化工与生物工程学院	58	122	6.0	9.0
4	周宇荀	东华大学化学化工与生物工程学院	53	102	6.0	9.0
5	高骏	东华大学化学化工与生物工程学院	2	0	0.0	0.0
9	孙凤萍	上海市农业科学院畜牧兽医研究所	33	87	5.0	8.0