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大豆Abhydrolase_3基因家族进化分析
大豆Abhydrolase_3基因家族进化分析
作者:
喻德跃
张培培
王娇
程浩
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大豆
Abhydrolase_3基因家族
进化
功能
基因复制
摘要:
异黄酮是大豆的重要次生代谢物,参与植物与微生物互作.2-羟基异黄酮脱水酶(hydroxyisoflavanone dehydratase,HID)催化2-羟基异黄酮形成稳定的异黄酮.HID属于Abhydrolase_3基因家族,该基因家族具有多种功能,但该基因家族在大豆中的进化模式尚待研究.为了研究Abhydrolase_3基因家族在大豆中的进化模式,本文在大豆基因组中鉴定了62个Abhydrolase_3基因,串联和片段复制是该基因家族主要扩增方式.根据系统进化关系,将大豆Abhydrolase_3基因家族划分为8个亚家族,其中HID所在的亚家族I基因数量最多,并发生多次基因扩增事件.对大豆bh ydrolase_3基因家族结构分析表明,不同亚家族具有不同的基序.多态性分析表明,亚家族Ⅰ、Ⅲ和Ⅴ具有较高的核苷酸差异,并受到放松的自然选择.基因表达分析表明,除了亚家族Ⅱ和Ⅳ外,其它亚家族的基因在大豆不同组织中有较高表达;亚家族Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ和Ⅵ基因受病原菌诱导表达.结果说明HID所在的亚家族Ⅰ存在基因扩增和功能分化,与病原菌互作相关的基因具有较高的遗传多样性并受病原菌诱导表达.
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文献信息
篇名
大豆Abhydrolase_3基因家族进化分析
来源期刊
大豆科学
学科
农学
关键词
大豆
Abhydrolase_3基因家族
进化
功能
基因复制
年,卷(期)
2017,(6)
所属期刊栏目
遗传育种·分子生物学
研究方向
页码范围
842-850
页数
9页
分类号
S565.1
字数
6744字
语种
中文
DOI
10.11861/j.issn.1000-9841.2017.06.0842
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
(32)
节点文献
引证文献
(2)
同被引文献
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研究主题发展历程
节点文献
大豆
Abhydrolase_3基因家族
进化
功能
基因复制
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
大豆科学
主办单位:
黑龙江省农业科学院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-9841
CN:
23-1227/S
开本:
大16开
出版地:
哈尔滨市南岗区学府路368号
邮发代号:
14-95
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
3361
总下载数(次)
6
总被引数(次)
32053
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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