糙皮侧耳发酵玉米秸秆转录组揭示木质素降解相关途径

• 作者: 范寰 赵飞 马蕊
• 来源期刊: 饲料研究
• 学科: 农学
• 关键词: 糙皮侧耳 木质素 转录组 差异基因 代谢途径
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 科技动态
• 页码范围: 42-48
• 页数: 7页
• 分类号: S816.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.13557/j.cnki.issn1002-2813.2017.09.011

摘要

木质素是影响生物质降解利用机制的重要组分,但其生物降解机制尚不清晰.利用白腐真菌糙皮侧耳菌株降解玉米秸秆过程中的基因表达变化,尝试挖掘木质素降解的关键生物代谢途径.通过发酵过程中5个木质素含量变化显著关键时间点的转录组测序发现,发酵过程中共有139个上调基因和308个下调基因.基因功能分类数据库(GO)功能分析结果表明,上调基因差异显著性较高的功能为囊泡运输、细胞定位、胞内定位、细胞过程、组蛋白甲基化、转移酶活性、异构酶活性和磷酸葡糖变位酶.基因产物在细胞中代谢途径数据库(KEGG)注释结果表明,上调基因差异显著性较高代谢通路为赖氨酸代谢、β-丙氨酸代谢、淀粉蔗糖代谢、半乳糖代谢和戊糖磷酸.13条与木质素降解直接有关的路径为苯甲酸代谢、二嗯英代谢、酚代谢、多环芳香烃(PAH)代谢、氨基苯甲酸代谢、萘代谢、甲苯代谢、脂肪酸代谢、醚酯代谢、二甲苯代谢、碳代谢、过氧化物酶体和溶酶体.