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摘要:
目的 了解2016年盐城市手足口病肠道病毒病原谱分布特征,并对鉴定为EV71、CVA16型肠道病毒VP1基因进行分子进化特征分析.方法 收集疑似手足口病咽肛拭子标本,采用实时荧光RT-PCR方法检测通用、EV71和CVA16型肠道病毒核酸,以RT-PCR法扩增其VP1基因全长编码区并进行序列分析,采用MegAlign、mafft、MEGA等软件进行核苷酸及氨基酸序列比对及基因种系进化特征分析.结果 2016年盐城市共收集疑似手足口病标本504份,检出肠道病毒核酸阳性165份,阳性率32.74%,EV71型、CVA16型、其他型别分别占4.37%、6.94%、21.43%.对EV71、CVA16型肠道病毒遗传进化树分析显示,盐城地区EV71和CVA16代表株分别属于C4a、B1b基因亚群进化分支,未发生基因亚群的转换,在各自进化分支中形成3条传播主链,远离各自原型株.结论 2016年盐城市手足病病原谱为多种基因型的肠道病毒共同流行.其他肠道病毒为优势病原体,EV71和CVA16仍占有一定比例.
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文献信息
篇名 2016年盐城市手足口病病原学特征及EV71和CVA16型肠道病毒VP1基因特征
来源期刊 江苏预防医学 学科 医学
关键词 手足口病 EV71 CVA16 VP1基因 序列分析
年,卷(期) 2017,(6) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 647-650
页数 4页 分类号 R512.5
字数 3339字 语种 中文
DOI 10.13668/j.issn.1006-9070.2017.06.13
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 邵荣标 35 147 6.0 10.0
2 王瑶 22 54 4.0 5.0
3 李峰 11 29 4.0 5.0
4 陈国清 6 29 3.0 5.0
5 李长城 3 22 3.0 3.0
6 徐士林 4 27 3.0 4.0
7 李春香 2 25 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
手足口病
EV71
CVA16
VP1基因
序列分析
研究起点
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
江苏预防医学
双月刊
1006-9070
32-1446/R
大16开
江苏省南京市172号
1990
chi
出版文献量(篇)
4951
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3
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19383
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