基于实时荧光定量PCR分析的北柴胡内参基因的筛选及验证

• 作者: 余马 侯大斌 刘丹 张洪 舒晓燕 黄晶
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 北柴胡 川北柴1号 内参基因 算法 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2017,（18）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3820-3825
• 页数: 6页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2017.18.024

摘要

目的 筛选出在北柴胡不同生长时期及不同器官中表达均稳定的内参基因并进行验证.方法 利用实时荧光定量PCR获得18个候选内参基因所有Ct值,通过3种不同算法(Bestkeeper、NormFinder、GeNorm)的软件对内参基因稳定性进行分析,采用皮尔森相关系数(Pearson correlation coefficient)分析3个软件给出的稳定性排名结果.结果 所有候选内参基因的Ct值相对宽泛,ADF1b、ADF5、ADF7、eIF2b和ACT2为最为合适的内参基因,而eIF6被认为稳定性最差的内参基因.3个软件计算结果均呈现显著性相关.结论 采用实时荧光定量PCR结合3种不同算法进行北柴胡内参基因的筛选及验证是可行的.在北柴胡柴胡分子遗传研究中,发掘到的内参基因对目的基因进行均一化处理有助于提高目的基因表达分析的精确性及可信度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	侯大斌	西南科技大学生命科学与工程学院	95	679	13.0	22.0
2	刘丹	西南科技大学生命科学与工程学院	14	43	3.0	6.0
3	舒晓燕	西南科技大学生命科学与工程学院	48	301	8.0	15.0
4	张洪	西南科技大学生命科学与工程学院	38	151	7.0	11.0
5	余马	西南科技大学生命科学与工程学院	38	74	5.0	6.0
6	黄晶	西南科技大学生命科学与工程学院	31	99	5.0	8.0