光唇鱼MSTN基因克隆、组织表达及SNP位点筛查

• 作者: 侯红红 李明云 潘娜 王礼闪 穆方申 苗亮 陈炯
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 光唇鱼 肌肉生长抑制素基因(MSTN) 组织表达 SNP
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 700-708
• 页数: 9页
• 分类号: S917.4|Q785
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.05.002

摘要

肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)是骨骼肌生长的负调控因子,MSTN基因在遗传育种上有很大的潜在应用价值.光唇鱼(Acrossocheilus fasciatus)是一种具有较大开发前景的经济鱼类,但其生长速度较慢.为了解光唇鱼MSTN基因的特征并为生长性状标记辅助选择提供基础资料,本研究克隆了光唇鱼MSTN cDNA和基因组DNA序列、检测了组织表达情况并进行了单核苷酸多态性(single nucleotidepolymorphism,SNP)位点筛查.结果表明,光唇鱼MST cDNA序列全长2 163 bp,含有一个1 128 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)、编码375个氨基酸,预测的编码蛋白具有脊椎动物MSTN的序列特征(如含有1个蛋白酶水解位点RIRR、C端有9个保守的半胱氨酸残基).基于MSTN氨基酸序列的比对显示不同鱼类之间MSTN序列同源性较高(＞80％),而鱼类与其他脊椎动物同源性较低(65％左右);光唇鱼与其他鲤科鱼类的MSTN基因高度同源(＞96.5％).系统进化树中鱼类聚为一枝、其他脊椎动物聚为另一枝,光唇鱼MSTN位于鲤科鱼类的小簇中.半定量RT-PCR检测显示,MSTN mRNA在光唇鱼脑和肌肉中高表达、肠和肝脏中有微弱表达、其他组织中均未见表达.光唇鱼MSTN基因的DNA序列全长5 828bp,含有3个外显子和2个内含子,在第二内含子中检测到10个SNP位点,但与生长性状(体重、体长)不存在显著相关性(P＞0.05).研究结果为探究光唇鱼MSTN基因的功能和筛选生长性状相关辅助育种标记提供了参考资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈炯	宁波大学教育部应用海洋生物技术重点实验室	100	594	13.0	18.0
2	李明云	宁波大学教育部应用海洋生物技术重点实验室	156	1723	22.0	34.0
3	苗亮	宁波大学教育部应用海洋生物技术重点实验室	43	184	8.0	10.0
4	潘娜	宁波大学教育部应用海洋生物技术重点实验室	3	8	2.0	2.0
5	穆方申	宁波大学教育部应用海洋生物技术重点实验室	6	7	2.0	2.0
6	侯红红	宁波大学教育部应用海洋生物技术重点实验室	7	5	1.0	2.0
7	王礼闪	宁波大学教育部应用海洋生物技术重点实验室	2	3	1.0	1.0