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miR-126-5p在沙子岭猪睾丸组织差异表达分析及功能预测
miR-126-5p在沙子岭猪睾丸组织差异表达分析及功能预测
作者:
冉茂良
吴买生
李智
翁波
董莲花
陈斌
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
沙子岭猪
miR-126-5p
生物信息学分析
精子生成
摘要:
利用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测miR-126-5p在沙子岭猪睾丸组织8个不同发育时期(E90、D1、D30 、D60、D90、D120、D150、D180)表达量,以了解其在动物睾丸发育及精子生成中的作用.利用miRanda、TargetScan和mirWalk 3个数据库预测miR-126-5p靶基因并取交集,利用David在线软件分析miR-126-5p靶基因的生物功能.结果表明,miR-126-5p在胚胎期(E90-D1)睾丸组织中高表达,而在生长期(D1-D90)表达量下调,但在沙子岭猪性成熟(D120)后表达量又上调,其中D1表达量最高,D90表达量最低,且二者与其他7个时期均差异极显著(P<0.01);D30、E90、D180相互之间差异不显著(P>0.05),且分别与其余各时期差异极显著(P<0.01);D120与D30差异显著(P<0.05),与其余各时期差异极显著(P<0.01);D150与D60之间差异不显著(P>0.05),二者分别与其余各时期差异极显著(P<0.01).miR-126-5p靶基因参与细胞增殖、凋亡、分化、细胞通讯、迁移及蛋白质转运等生物学过程(P<0.001);靶基因分子功能包括蛋白二聚体活性、配体依赖性核受体活性(P<0.001);KEGG分析显示miR-126-5p靶基因参与TGF-β、MAPK、细胞黏附等信号通路(P<0.01).结合miR-126-5p在睾丸组织不同发育时期表达差异结果及其靶基因功能预测结果,miR-126-5p可能参与沙子岭猪生殖细胞分化及精子生成调控,本研究为miR-126-5p在动物精子生中的作用及其调控机制的研究提供依据.
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文献信息
篇名
miR-126-5p在沙子岭猪睾丸组织差异表达分析及功能预测
来源期刊
家畜生态学报
学科
农学
关键词
沙子岭猪
miR-126-5p
生物信息学分析
精子生成
年,卷(期)
2017,(7)
所属期刊栏目
科学研究
研究方向
页码范围
20-25
页数
6页
分类号
S811.5
字数
3454字
语种
中文
DOI
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生物信息学分析
精子生成
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期刊影响力
家畜生态学报
主办单位:
西北农林科技大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1673-1182
CN:
61-1433/S
开本:
16开
出版地:
陕西杨凌西北农林科技大学
邮发代号:
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
3988
总下载数(次)
5
总被引数(次)
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家畜生态学报2017年第3期
家畜生态学报2017年第2期
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家畜生态学报2017年第11期
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