利用蛋白质组技术快速鉴定噬菌体结构蛋白

• 作者: 任慧英 孙强 安小平 童贻刚 米志强 裴广倩 赵飞扬 邢少贞
• 来源期刊: 中国抗生素杂志
• 关键词: 噬菌体 vB_EfaP_IME199 基因组学 蛋白质组学
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 噬菌体专辑
• 页码范围: 760-765
• 页数: 6页
• 分类号: R978.1|Q939.48
• 语种: 中文

摘要

为快速鉴定噬菌体的结构蛋白,并且发现具有新功能的蛋白,为噬菌体功能的研究提供基础.本研究用临床分离到的屎肠球菌为指示菌,从医院污水中分离到1株裂解性噬菌体,命名为vB_EfaP_IME 199.对噬菌体大量培养、浓缩和纯化,然后进行蛋白质组学分析、全基因组测序,进化分析,确定该噬菌体为短尾噬菌体科,全基因组序列长为18839bp,GC含量为34.6％.在线注释预测该噬菌体基因组功能基因,注释出22个ORFs,其中11个ORFs为假想蛋白序列,其余11个ORFs的功能已知.采用质谱技术对浓缩纯化的噬菌体进行蛋白质组分析,共鉴定出11个蛋白质,其中有6个蛋白为功能已知的结构蛋白,其余为假想蛋白.本实验利用蛋白质组技术快速有效的鉴定出噬菌体的结构蛋白,建立了一种噬菌体蛋白的分析方法,为该噬菌体的基因功能研究提供了基础.