中华鳖gp130基因全长cDNA克隆及生物信息学分析

• 作者: 宋如昕 张左兵 王兰
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 中华鳖 糖蛋白130(GP130) cDNA末端快速扩增(RACE)
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 265-273
• 页数: 9页
• 分类号: Q78
• 字数: 4127字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2017.03.006

摘要

目的:从中华鳖脾脏、肝脏、肠道构建的SMART cDNA文库中克隆中华鳖gpJ 30基因cDNA全长.方法:采用RACE法克隆中华鳖gp130基因全长cDNA,并对其进行生物信息学分析.结果:中华鳖gp130基因cDNA全长3806 bp,对应基因组全长73 252 bp,包含16个内含子及17个外显子.中华鳖gp130与鸟类、哺乳类相比均有保守的共线性关系.该基因编码由927个氨基酸残基构成的序列,二级结构主要包括α螺旋、延伸链、无规则卷曲、β转角,三级结构包含配体结合、跨膜结构域、纤维链接蛋白结构域等.系统进化分析显示与鸟类首先聚类,其次是哺乳类,最后是两栖类与鱼类.同时以人GP130蛋白为模型构建了中华鳖GP130蛋白的3D结构模型,一致性为58.32％.结论:获得了中华鳖gp130基因全长并做了生物信息学分析,为深入研究GP130及相关信号通路提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王兰	山西大学生命科学学院	123	1118	16.0	28.0
2	张左兵	山西大学生命科学学院	6	5	2.0	2.0
3	宋如昕	山西大学生命科学学院	3	6	2.0	2.0