水稻耐盐性QTL的meta分析及候选基因发掘

• 作者: 刘化龙 孙健 杨洛淼 王敬国 赵宏伟 邹德堂 郑洪亮 雷蕾
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 水稻 耐盐性状 元分析 候选基因
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 页码范围: 45-53
• 页数: 9页
• 分类号: Q37|Q78
• 字数: 5962字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2017.06.007

摘要

为了获得真实有效的水稻耐盐性QTL信息,并缩小QTL的置信区间以及预测区间内的候选基因.以水稻6个遗传图谱的整合结果为公共图谱,并收集344个与水稻耐盐性相关的QTL.利用BioMercator V4.2,在图谱整合的基础上,对一致性QTL区间的注释基因进行生物信息学分析.结果表明:共检测到46个和水稻耐盐性相关的一致性QTL,对其中8个物理距离在0.5 Mb附近的一致性QTL区间进行了物理图谱定位和候选基因分析,共有1489个预测基因被检测到,参与了细胞合成、催化活性、水解酶活性和新陈代谢等主要功能.对一致性QTL区间内已克隆的水稻耐盐基因进行蛋白序列分析后,发现9个候选基因同已知耐盐基因的保守结构域相似,分别为OS01G0813100、OS01G0869900、OS02G0753000、OS03G0282100、OS03G0607700、OS07G0150500、OS09G0369050、OS09G0434500和OS09G0522100.研究发现的遗传距离小于0.1 cM的Mqtl两端的标记可用于分子标记辅助育种,发掘的9个和水稻耐盐基因具有高度蛋白序列相似性的注释基因,可为水稻耐盐性基因的克隆和功能验证奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵宏伟	东北农业大学水稻研究所	151	1290	17.0	28.0
2	刘化龙	东北农业大学水稻研究所	68	489	13.0	17.0
3	王敬国	东北农业大学水稻研究所	73	521	13.0	18.0
4	郑洪亮	东北农业大学水稻研究所	13	113	7.0	10.0
5	孙健	东北农业大学水稻研究所	48	266	10.0	14.0
6	杨洛淼	东北农业大学水稻研究所	5	25	3.0	5.0
7	雷蕾	东北农业大学水稻研究所	5	36	3.0	5.0