基于cDNA-AFLP技术分析半膜覆盖下玉米大喇叭口期基因差异表达

• 作者: 李倩 李玉东 王玉芬 白岚方 郭九峰 马梦宇 高海荣
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 栽培方式 半膜覆盖 cDNA-AFLP 差异表达
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 2310-2317
• 页数: 8页
• 分类号: S513
• 字数: 5704字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2017.12.018

摘要

为了探讨半膜覆盖调控玉米生长的差异表达基因及分子机制,以‘浚单29’为材料,露地栽培作为对照,与半膜覆盖间隔种植,利用cDNA-AFLP技术,采用90对单引物筛选半膜覆盖下差异表达基因,并进行生物信息学分析.结果表明,利用90对单引物组合共扩增出2 298条差异片段,其中上调表达的有1 429条,占总条带数的45％;下调表达的有869条,占总条带数的23.7％;无差异表达的有877条,占总条带数的27.6％.选择重复扩增稳定的20条差异片段进行回收测序,经过Blast数据库对比和基因注释分析,再将所得的15条差异片段按功能分为细胞骨架相关基因(13.3％)、能量代谢相关基因(13.3％)、细胞挽救和防御相关基因(6.7％)、转录过程相关基因(40％)、胞内转运相关基因(6.7％)和未知功能基因(20％)6大类.分析其中一些重要的基因,如RPM1在逆境抗性中起作用,NYM锌指蛋白、BCAS2蛋白和EIF3B翻译起始因子都与调控转录翻译相关.通过cDNA-AFLP技术筛选了多个半膜覆盖下差异表达的基因,为揭示半膜覆盖影响玉米生长发育的分子机制提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王玉芬	内蒙古大学生命科学学院	33	125	7.0	9.0
2	郭九峰	内蒙古大学物理科学与技术学院离子束生物工程重点实验室	31	97	6.0	8.0
3	马梦宇	内蒙古大学物理科学与技术学院离子束生物工程重点实验室	2	2	1.0	1.0
4	白岚方	内蒙古大学生命科学学院	5	8	2.0	2.0
5	高海荣	内蒙古大学生命科学学院	3	5	1.0	2.0
6	李倩	内蒙古大学物理科学与技术学院离子束生物工程重点实验室	1	1	1.0	1.0
7	李玉东	内蒙古大学生命科学学院	1	1	1.0	1.0