不动杆菌JH250-8邻苯二酚双加氧酶基因的克隆及分析

• 作者: 丁月玲 孙广仁 孙鹏 王瑞俭 王莉 王金玲
• 来源期刊: 北华大学学报（自然科学版）
• 学科: 地球科学
• 关键词: 不动杆菌 邻苯二酚双加氧酶 基因克隆 结构预测
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 生物科学·基础医学·药学
• 页码范围: 329-335
• 页数: 7页
• 分类号: Q812|X53
• 字数: 4025字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11713/j.issn.1009-4822.2017.03.011

摘要

目的 研究不动杆菌JH250-8的石油降解机制,克隆并分析其邻苯二酚双加氧酶基因.方法 应用数据库的同源序列设计引物,对不动杆菌JH250-8邻苯二酚1,2-双加氧酶(C12O)和邻苯二酚2,3-双加氧酶(C23O)基因进行扩增,并用生物信息学软件及在线生物分析工具等分析编码蛋白质.结果 不动杆菌JH250-8中同时含有C12O和C23O两种邻苯二酚双加氧酶;扩增的DNA序列长度分别为1299和1118 bp,蛋白质编码区长度为1047和930 bp,分别编码358和309个氨基酸;两个邻苯二酚双加氧酶等电点(pI)分别为5.03和4.79,均为酸性蛋白质;酶分子中都含有较多极性和可电离氨基酸,在水中有较好的溶解性,但由于N端都有一段疏水性肽段,可能会影响其水溶液的稳定性;在蛋白质二级结构上,两个酶分子中都有较丰富的二级结构单元,既有较好的稳定性,又有较好的底物适应性.C12O的三级结构由同型二聚体构成,每个亚基上都结合有Fe3+;C23O三级结构的核心由两组β-折叠构成,另有4个α-螺旋结构分布于外侧.结论 不动杆菌JH250-8有两种邻苯二酚双加氧酶,两种酶均为酸性蛋白质,有较好的水溶性及结构稳定性.分析结果对邻苯二酚双加氧酶的后续研究有重要的参考价值及指导意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王金玲	北华大学林学院	9	21	3.0	4.0
2	孙广仁	北华大学林学院	50	186	7.0	11.0
3	王莉	北华大学林学院	2	1	1.0	1.0
4	孙鹏	北华大学林学院	3	3	1.0	1.0
5	王瑞俭	北华大学林学院	9	11	2.0	3.0
6	丁月玲	北华大学林学院	1	1	1.0	1.0