罗氏沼虾种群SSR分析中样本量及标记量对遗传多样性指标的影响

• 作者: 刘洁 戴习林 明磊 李晶晶 江宗冰 蒋飞
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 罗氏沼虾 遗传多样性 微卫星 样本量
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 页码范围: 1083-1095
• 页数: 13页
• 分类号: Q785|S968.2
• 字数: 4561字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20160410360

摘要

利用60对微卫星分子标记分别对罗氏沼虾3个养殖群体进行遗传多样性分析,通过比较样本量及标记量对遗传多样性指标的影响,探讨最适宜的样本量及标记量.结果显示,样本量和标记量的大小均对遗传多样性指数有较大的影响,其中样本量与平均等位基因数和平均有效等位基因数呈高度正相关,与杂合度和Nei氏遗传多样性指数分别呈中度、高度相关,样本量为10~30时,遗传参数变化差异显著,样本量大于30,变化差异不显著;标记量与遗传参数也存在不同程度的相关性,标记量为5~25时,各遗传多样性指数变化有明显差异,标记量大于25时,各遗传参数变化较小,多态信息含量不同的标记直接影响到群体遗传参数.性别对群体遗传多样性指标无显著性影响.研究表明,应尽可能选择多态信息含量高的微卫星分子标记开展罗氏沼虾群体遗传多样性分析,可不考虑样本性别,样本量不宜小于30,标记量不宜少于25.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	戴习林	上海海洋大学水产与生命学院	79	681	14.0	20.0
2	刘洁	上海海洋大学水产与生命学院	2	12	2.0	2.0
3	李晶晶	上海海洋大学水产与生命学院	3	16	3.0	3.0
4	江宗冰	上海海洋大学水产与生命学院	2	7	1.0	2.0
5	明磊	上海海洋大学水产与生命学院	2	7	1.0	2.0
6	蒋飞		5	16	2.0	4.0