芝麻全基因组Hsp70基因的鉴定与生物信息学分析

• 作者: 刘剑光 徐剑文 肖松华 赵君
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芝麻 Hsp70基因 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·生理生化
• 页码范围: 493-502
• 页数: 10页
• 分类号: S565.301
• 字数: 5236字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2017.03.003

摘要

利用隐马可链夫模型(HMM)对芝麻全基因组Hsp70基因进行了系统分析,共鉴定出21个Hsp70基因,其中17个属于Dnak基因亚家族,4个属于Hsp110/SSE基因亚家族.根据系统进化树分析和亚细胞定位结果,将芝麻21个Hsp70基因分为6个亚组,其中I亚组3个,定位于叶绿体;II亚组2个,定位于线粒体;III亚组5个,定位于内质网;IV亚组6个,定位于细胞质基质;V亚组4个,属于Hsp110/SSE基因家族;VI亚组1个.芝麻Hsp70基因启动子区域顺式作用元件功能预测结果显示,Hsp70基因参与芝麻的生长发育和逆境胁迫响应等生理过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖松华	江苏省农业科学院经济作物研究所	106	1022	17.0	25.0
2	刘剑光	江苏省农业科学院经济作物研究所	102	1033	18.0	25.0
3	徐剑文	江苏省农业科学院经济作物研究所	6	9	2.0	3.0
4	赵君	江苏省农业科学院经济作物研究所	9	35	3.0	5.0