辽宁沿海日本海马线粒体控制区序列变异及其在海龙科鱼类系统分析中的应用

• 作者: 于旭光 付杰 李玉龙 李轶平 王彬 王爱勇 董婧 韩振华
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 日本海马 海龙科 线粒体DNA 控制区序列 序列变异 系统分析
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 页码范围: 1073-1082
• 页数: 10页
• 分类号: Q785|S965
• 字数: 5272字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20151210204

摘要

为研究日本海马野生群体的种质资源及遗传多样性状况,实验采用PCR扩增法获得日本海马线粒体DNA的控制区序列片段,同时利用GenBank数据库中已有的14种海龙科鱼类控制区同源序列对其进行序列比较及系统进化分析.结果显示,日本海马控制区序列片段长度为557~558 bp,其A、T、G、C 4种碱基的平均含量分别为34.3%,29.7%,14.1%,21.9%.在控制区序列片段中,共检测到16个多态性核苷酸位点,定义了16种单倍型,其核苷酸多态度和单倍型多态度都较低(π=0.0032±0.0021,h=0.70±0.02).利用GenBank数据库中已有的海马控制区同源序列,采用邻接法、最大似然法和贝叶斯法构建了分子系统树.结果显示,采用最大似然法和贝叶斯法构建的分子系统树拓扑结构与邻接法构建的分子系统树拓扑结构不完全相同但基本一致,系统进化分析结果与形态分类学的观点一致.研究表明,线粒体DNA控制区序列在海龙科不同阶元间变异较大,适合于海龙科鱼类种间、群体水平的研究以及作为系统进化分析的分子标记.