高光胁迫下坛紫菜定量PCR内参基因的筛选

• 作者: 徐燕 昌晶 纪德华 谢潮添 陈昌生 陈陆丹
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 坛紫菜 高光胁迫 内参基因 qRT-PCR
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 页码范围: 1064-1072
• 页数: 9页
• 分类号: Q785|S968.4
• 字数: 5509字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20160810518

摘要

为了筛选不同高光光强胁迫下坛紫菜中表达水平最为稳定的内参基因,本研究采用qRT-PCR技术测定了植物中常用的6种内参基因UBC、TUB、18S、EF2、ACT和GAPDH在不同光照强度下培养的坛紫菜藻体中的绝对表达水平,并采用比较Ct值法、GeNorm、Bestkeeper和NormFinder软件分析4种方法对6种候选内参基因的表达稳定性进行评估.结果显示,UBC的Ct值变化范围最小,18S的Ct值变化范围最大;geNorm软件分析结果显示最稳定的内参基因为UBC和EF2;Bestkeeper和NormFinder软件分析结果类似,UBC基因的稳定值M均为最低值(分别为0.044和0.80),说明其表达水平最稳定.研究表明,UBC基因可以作为不同光照条件下坛紫菜基因表达qRT-PCR分析的最适内参基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈昌生	集美大学水产学院	82	1194	18.0	30.0
2	纪德华	集美大学水产学院	62	860	15.0	26.0
3	谢潮添	集美大学水产学院	58	735	14.0	25.0
4	徐燕	集美大学水产学院	52	521	13.0	20.0
5	陈陆丹	集美大学水产学院	2	7	2.0	2.0
6	昌晶	集美大学水产学院	1	2	1.0	1.0