沙柳SpsLAZY1a和SpsLAZY1b基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 叶志玮 张国盛 张磊 杨海峰 赵晨曦
• 来源期刊: 西北林学院学报
• 关键词: 沙柳 分枝角度 LAZY1 基因克隆
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 林木遗传育种与培育
• 页码范围: 98-105
• 页数: 8页
• 分类号: S718.46
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7461.2017.01.16

摘要

LAZY1基因对于植物分枝角度、分枝方向具有重要影响.以沙柳为试验材料克隆LAZY1基因,利用生物信息学软件分析LAZY1基因序列、构建进化树,并预测蛋白结构.结果表明,Sps-LAZY1a和SpsLAZY1b的CDS全长分别为1 161、1 143 bp,分别编码386和380个氨基酸.生物信息学分析表明SpsLAZY1a、SpsLAZY1b 2种蛋白均为亲水性蛋白,均无信号肽区域.氨基酸序列具有IGT基因家族典型结构域,并且其C端有LAZY1蛋白的典型EAR结构.系统发育树将18个LAZY1蛋白家族聚为2个大类,SpsLAZY1a和SpsLAZY1b属于其中第1类,均为双子叶植物,并与其他植物具有较高相似性.氨基酸同源结构比对发现这些植物间既有相似同源区域,也存在一定差异区域.单子叶比双子叶植物缺少某些同源区域,草本比木本植物又缺少某些同源区域.LAZY1基因在沙柳进化过程中发生基因重复,本研究由沙柳中成功克隆SpsLAZY1a、Sps-LAZY1b基因,隶属IGT基因家族,并初步揭示LAZY基因的系统进化关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张国盛	内蒙古农业大学林学院	91	1245	20.0	31.0
2	张磊	内蒙古农业大学林学院	37	257	8.0	15.0
3	杨海峰	内蒙古农业大学林学院	16	29	3.0	4.0
4	叶志玮	内蒙古农业大学林学院	1	6	1.0	1.0
5	赵晨曦	内蒙古农业大学林学院	1	6	1.0	1.0