利用小RNA深度测序技术鉴定海南南瓜病毒种类

• 作者: 刘勇 曹学仁 罗大全 车海彦
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 小RNA深度测序 海南 南瓜病毒病
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 2106-2111
• 页数: 6页
• 分类号: S432.1
• 字数: 3108字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2017.11.018

摘要

2016年在海南乐东、昌江、澄迈、海口、文昌、儋州等地采集疑似被病毒病感染的南瓜叶片样品6个,将样品合并,采用小RNA深度测序技术对上述混合样本的病毒种类进行鉴定,发现样本中含有黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、番木瓜环斑病毒(Papara ringspot virus,PRSV)、黄瓜绿斑驳病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)和中国南瓜曲叶病毒(Squash leaf curl China virus,SLCCNV),通过PCR方法进一步验证了深度测序结果的准确性.SLCCNV在4个样品中存在,P-CJ分离物的DNA-A和DNA-B组分全长分别为2 735 bp(登录号为MF062251)和2 722 bp(登录号为MF062252).DNA-A和DNA-B组分均与SLCCNV分离物的同源性最高,同源性分别为89.2％～99.3％和79.1％～98.8％;P-CJ分离物与从中国植物样品中分离到的SLCCNV聚在同一进化分支上.上述研究结果表明,P-CJ是SLCCNV的一个分离物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘勇		106	928	17.0	23.0