大黄鱼microRNA荧光定量PCR中内参基因的选择与评价

• 作者: 张玉 曹明月 李娟 薛良义 赵亚运 黄红丽
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 大黄鱼 microRNA 内参基因 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1299-1309
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2017.07.1299

摘要

为筛选适用于大黄鱼miRNA研究的内参基因,选取饥饿试验组(EG)中饥饿21d及正常投喂组(CG,对照)的大黄鱼肌肉组织进行miRNA高通量测序,初步筛选得到稳定表达的6个miRNA:miR-23a-3p,miR-4508,miR-1961,miR-1297,miR-1956-3p和Let-7.采用实时荧光定量PCR法检测这6个miRNA和3个传统的内参基因(U6,5S和18S)在大黄鱼6种组织(肌肉、肝脏、肾、脾、脑和心脏)以及不同饥饿时间段的肌肉组织中的表达,并利用GeNorm,BestKeeper以及NormFinder对数据进行分析.结果表明,miRNA的表达稳定性优于传统内参基因.在CG组大黄鱼不同组织中,最稳定单内参基因是miR-23a-3p,最佳内参基因组合为miR-23a-3p和Let-7.在不同饥饿时间的EG组大黄鱼肌肉组织中,最稳定单内参基因是miR-23a-3p,最佳内参基因组合为Let-7和miR-1961.本试验结果为研究大黄鱼miRNA时内参基因的选择提供了参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李娟	宁波大学海洋学院	17	33	3.0	4.0
2	薛良义	宁波大学海洋学院	82	601	14.0	21.0
6	张玉	宁波大学海洋学院	6	26	3.0	5.0
7	黄红丽	宁波大学海洋学院	4	11	2.0	3.0
8	曹明月	宁波大学海洋学院	4	12	3.0	3.0
9	赵亚运	宁波大学海洋学院	4	12	3.0	3.0