一种新的氨基酸描述符及其在肽QSAR中的应用

• 作者: 仝建波 占培 吴英纪 李康楠 李玲霄
• 来源期刊: 分析测试学报
• 学科: 化学
• 关键词: 定量构效关系 氨基酸描述符 多元线性回归 肽
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 224-229,235
• 页数: 7页
• 分类号: O641.121|O629.76
• 字数: 3719字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-4957.2017.02.012

摘要

从20种天然氨基酸的41个randic molecular profiles非零描述符、44个eigenvalue based indices非零描述符和47个walk and path counts非零描述符分别进行主成分分析,得出一种新的氨基酸描述符-SVREW.将其应用于血管紧张素转化酶(ACE)抑制二肽和ACE抑制三肽、苦味二肽和苦味四肽、后叶催产素类似物、HLA-A*0201限制性CTL表位肽的结构表征,应用多元线性回归(MLR)建立定量构效关系模型,同时采用内部与外部双重验证的方法验证模型的稳定性.所建ACE抑制二肽、ACE抑制三肽、苦味二肽、苦味四肽、后叶催产素类似物、HLA-A* 0201限制性CTL表位肽的模型复相关系数(Rcum)分别为0.994,0.797,0.948,0.878,0.686,0.720;留一法交互校验复相关系数(Rev)分别为0.955,0.859,0.879,0.958,0.796,0.843;外部样本校验相关系数(Q2ext)分别为0.990,0.954,0.890,0.950,0.748,0.773.经研究表明SVREW描述符用于肽分子结构表征所建模型的稳定性与预测能力均较好,有望成为多肽定量构效关系研究中一种有效的结构表征方法,可对新药物的发现和研究提供指导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	仝建波	陕西科技大学化学与化工学院	59	196	6.0	9.0
2	李康楠	陕西科技大学化学与化工学院	6	9	2.0	2.0
3	占培	陕西科技大学化学与化工学院	7	11	2.0	3.0
4	吴英纪	陕西科技大学化学与化工学院	8	13	2.0	3.0
5	李玲霄	陕西科技大学化学与化工学院	1	0	0.0	0.0