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高通量测序分析凡纳滨对虾育苗期水体菌群结构特征
高通量测序分析凡纳滨对虾育苗期水体菌群结构特征
作者:
何瑶瑶
刘杨锋
梁华芳
温崇庆
王立群
薛明
邱孟德
陈第省
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
凡纳滨对虾
水体菌群
育苗期
细菌多样性
高通量测序
摘要:
为了解凡纳滨对虾育苗期正常苗池水体菌群结构和多样性变化,实验采用Illumina MiSeq高通量测序水体细菌16S rDNA V4区,比较幼体在无节V期(N5)、溞状Ⅱ期(Z2)、糠虾Ⅰ期(M1)与仔虾Ⅰ期(P1)时的水体菌群特征.结果显示,水体菌群Shannon多样性指数随幼体发育先降后升,而Pielou均匀度指数除在N5时稍高外,在其余阶段都很接近.育苗期间,变形菌门为水体绝对优势菌群(50.0%~88.0%),尤其红杆菌科从N5到P1阶段分别占24.2%、61.6%、43.3%和51.8%;拟杆菌门在各期丰度均>9.7%,其中腐螺旋菌科以5.3%~16.9%优势分布于后3个阶段;放线菌门在后3个期都为优势类群,并以微杆菌科为主,丰度分别达5.6%、37.6%和10.8%;而疣微菌门只在P1时表现为优势(5.3%).苗池水体核心菌属主要由洛克氏菌、海命菌、栖东海菌、亚硫酸杆菌和2个分类未定属构成.可见水体菌群呈高度多样而动态变化,且N5菌群明显区别于后3个阶段.育苗期间水体主要环境因子总体波动较小,对优势操作分类单元(OTU)丰度分布无显著影响.研究表明,凡纳滨对虾健康苗池水体菌群随幼体发育和饵料投喂而明显更替,其中核心菌群的潜在功能对维持水体生态系统稳定起重要作用,可为对虾育苗益生菌与健康苗池指示菌的筛选提供依据.
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文献信息
篇名
高通量测序分析凡纳滨对虾育苗期水体菌群结构特征
来源期刊
水产学报
学科
农学
关键词
凡纳滨对虾
水体菌群
育苗期
细菌多样性
高通量测序
年,卷(期)
2017,(5)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
785-794
页数
10页
分类号
S968.2
字数
7467字
语种
中文
DOI
10.11964/jfc.20160210291
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
薛明
广东海洋大学水产学院
23
170
9.0
12.0
2
温崇庆
广东海洋大学水产学院
24
179
10.0
13.0
3
梁华芳
广东海洋大学水产学院
39
208
8.0
12.0
4
何瑶瑶
广东海洋大学水产学院
2
35
2.0
2.0
5
邱孟德
广东海洋大学水产学院
1
15
1.0
1.0
6
陈第省
广东海洋大学水产学院
1
15
1.0
1.0
7
王立群
广东海洋大学水产学院
1
15
1.0
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刘杨锋
广东海洋大学水产学院
1
15
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传播情况
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水体菌群
育苗期
细菌多样性
高通量测序
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
水产学报
主办单位:
中国水产学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-0615
CN:
31-1283/S
开本:
大16开
出版地:
上海市临港新城沪城环路999号
邮发代号:
4-297
创刊时间:
1964
语种:
chi
出版文献量(篇)
3756
总下载数(次)
11
总被引数(次)
60406
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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水产学报2017年第1期
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