高通量测序分析凡纳滨对虾育苗期水体菌群结构特征

• 作者: 何瑶瑶 刘杨锋 梁华芳 温崇庆 王立群 薛明 邱孟德 陈第省
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 凡纳滨对虾 水体菌群 育苗期 细菌多样性 高通量测序
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 页码范围: 785-794
• 页数: 10页
• 分类号: S968.2
• 字数: 7467字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20160210291

摘要

为了解凡纳滨对虾育苗期正常苗池水体菌群结构和多样性变化,实验采用Illumina MiSeq高通量测序水体细菌16S rDNA V4区,比较幼体在无节V期(N5)、溞状Ⅱ期(Z2)、糠虾Ⅰ期(M1)与仔虾Ⅰ期(P1)时的水体菌群特征.结果显示,水体菌群Shannon多样性指数随幼体发育先降后升,而Pielou均匀度指数除在N5时稍高外,在其余阶段都很接近.育苗期间,变形菌门为水体绝对优势菌群(50.0%~88.0%),尤其红杆菌科从N5到P1阶段分别占24.2%、61.6%、43.3%和51.8%;拟杆菌门在各期丰度均>9.7%,其中腐螺旋菌科以5.3%~16.9%优势分布于后3个阶段;放线菌门在后3个期都为优势类群,并以微杆菌科为主,丰度分别达5.6%、37.6%和10.8%;而疣微菌门只在P1时表现为优势(5.3%).苗池水体核心菌属主要由洛克氏菌、海命菌、栖东海菌、亚硫酸杆菌和2个分类未定属构成.可见水体菌群呈高度多样而动态变化,且N5菌群明显区别于后3个阶段.育苗期间水体主要环境因子总体波动较小,对优势操作分类单元(OTU)丰度分布无显著影响.研究表明,凡纳滨对虾健康苗池水体菌群随幼体发育和饵料投喂而明显更替,其中核心菌群的潜在功能对维持水体生态系统稳定起重要作用,可为对虾育苗益生菌与健康苗池指示菌的筛选提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛明	广东海洋大学水产学院	23	170	9.0	12.0
2	温崇庆	广东海洋大学水产学院	24	179	10.0	13.0
3	梁华芳	广东海洋大学水产学院	39	208	8.0	12.0
4	何瑶瑶	广东海洋大学水产学院	2	35	2.0	2.0
5	邱孟德	广东海洋大学水产学院	1	15	1.0	1.0
6	陈第省	广东海洋大学水产学院	1	15	1.0	1.0
7	王立群	广东海洋大学水产学院	1	15	1.0	1.0
8	刘杨锋	广东海洋大学水产学院	1	15	1.0	1.0