玉米HSP70基因家族的全基因组鉴定与分析

• 作者: 刘颖慧 宋晋辉 瓮巧云 袁进成 赵艳 马海莲
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 玉米 HSP70 生物信息态 系统进化树 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1245-1254
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2017.07.1245

摘要

热激蛋白70(HSP70)是生物体应答各种胁迫反应产生的一类蛋白,广泛存在于生物体中,在几乎所有的活细胞中都起着重要的作用.为全面解析玉米基因组HSP70基因信息,利用从Pfam数据库中下载的隐马氏模型文件PF00012在Gramene数据库进行基因搜索,并利用多种生物软件或在线工具对所鉴定的基因进行生物信息学分析.结果表明,试验共鉴定得到35个玉米HSP70基因,分别命名为ZmHSP70-1～ZmHSP70-35.这些基因不均衡地分布在玉米的10条染色体上,其中5号染色体上分布最多(6个),9号染色体上分布最少(1个).进化树分析显示35个基因聚为6组,且同组基因具有相似的基因结构,其基序数量、类型和顺序也是相似的.物种间进化树分析不同物种的86个基因,存在8对直系同源基因和17对旁系同源基因,直系同源基因中7对存在于玉米和水稻之间,仅1对存在于水稻和拟南芥之间,说明起源于共同祖先基因的直系同源基因对虽在单/双子叶植物差异分离前就存在,但玉米与水稻间的进化关系要比与拟南芥间更为亲近.表达谱分析表明,大多数ZmHSP70基因属组成型表达,但表达模式和表达量不同.本研究结果为进一步研究玉米HSP70家族基因的功能奠定了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋晋辉	河北北方学院植物保护系	29	101	5.0	8.0
2	瓮巧云	河北北方学院植物保护系	31	93	5.0	8.0
3	马海莲	河北北方学院植物保护系	21	101	6.0	9.0
4	刘颖慧	河北北方学院植物保护系	55	255	9.0	13.0
5	袁进成	河北北方学院植物保护系	36	194	9.0	12.0
6	赵艳	河北北方学院植物保护系	5	41	4.0	5.0