胡椒实时荧光定量PCR内参基因的筛选

• 作者: 伍宝朵 吴刚 胡丽松 范睿 谭乐和 郝朝运
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 胡椒 实时荧光定量PCR 内参基因
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术,组织培养
• 页码范围: 1901-1906
• 页数: 6页
• 分类号: Q949.732.3
• 字数: 3682字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2017.10.021

摘要

为筛选胡椒不同组织间稳定表达的最佳内参基因,以胡椒栽培种‘热引1号’的主根、主蔓、花序和不同发育时期果实共8个组织为材料,采用实时荧光定量PCR技术,分析Polyubiquitin 1、Polyubiquitin2、Polyubiquitin3、GAPDH 1、GAPDH 2、Histone 3-1、Histone 3-2、Cyclophilin、Actin等共9个不同持家基因的表达差异情况.基于各个基因的Ct值,利用geNorm、NormFinder和BestKeeper分析候选持家基因表达的稳定性.结果表明,在不同的组织中,9个持家基因的表达量存在差异.3个软件分析出的结果有所不同,综合分析结果显示,Histone 3-1表达最为稳定,其次为Polyubiquitin1、GAPDH-2.内参基因标准化因子的配对差异分析(Vn/n+1)表明,Histone 3-1和Polyubiquitin 1是分析胡椒基因表达模式的最佳内参基因组合.