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凉山州龙肘山锈红杜鹃与薄叶马银花根部真菌分子检测
凉山州龙肘山锈红杜鹃与薄叶马银花根部真菌分子检测
作者:
丁琼
廖映辉
张琪
黄彩微
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
内转录间隔(ITS)区
杜鹃花属
根系共生菌
序列分析
系统综述法
摘要:
[目的]为检验直接分子检测法用于揭示杜鹃花属(Rhododendron)植物根部真菌(Root-associated fungi,RAF)组成的有效性.[方法]采用不依赖于培养的分子检测技术直接从锈红杜鹃(R.bureavii)与薄叶马银花(R.leptothrium)的发根(Hair root)提取DNA,用真菌特异性引物扩增rDNA-ITS区、经克隆后测序,对获得的ITS序列进行分析;通过收集NCBI中与本研究的RAF相似性97%以上的所有序列对应的真菌来源(土壤或根系的身份)数据,分析真菌的生态学特性,并用FUNGuild软件提供的方法划分真菌的生态类型.[结果]从两种杜鹃花根部共检测到15种真菌,其中担子菌门(Basdiomycota)真菌3种,子囊菌门(Ascomycota)真菌12种.柔膜菌目(Helotiales)真菌在两种杜鹃花RAF群落中占据优势,并且在两种杜鹃花根系中均检测到该类真菌.此外,两种杜鹃花根部有多种生态类型的RAF共存,包括曾被频繁报道的杜鹃花类菌根菌Oidiodendron sp.和Rhizoscyphus sp.、内生真菌Phialocephala fortinii、共生一致病过渡型真菌Pezoloma ericae、外生菌根共生菌Meliniomyces sp.,以及腐生型真菌Myceana sp.、Lachnum virgineum、Herpotrichia Sp.o[结论]直接分子检测法从两种杜鹃花属植物根部检测到的真菌谱系多样性较高、生态类型复杂,这一方法能较为全面地反映杜鹃花属植物RAF多样性.
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篇名
凉山州龙肘山锈红杜鹃与薄叶马银花根部真菌分子检测
来源期刊
微生物学通报
学科
关键词
内转录间隔(ITS)区
杜鹃花属
根系共生菌
序列分析
系统综述法
年,卷(期)
2017,(5)
所属期刊栏目
农业微生物
研究方向
页码范围
1108-1120
页数
13页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13344/j.microbiol.china.160546
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张琪
海南大学园艺园林学院
12
36
4.0
5.0
2
丁琼
海南大学园艺园林学院
10
36
3.0
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3
黄彩微
海南大学园艺园林学院
4
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2.0
3.0
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廖映辉
海南大学园艺园林学院
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根系共生菌
序列分析
系统综述法
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
微生物学通报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国微生物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0253-2654
CN:
11-1996/Q
开本:
16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
邮发代号:
2-817
创刊时间:
1974
语种:
chi
出版文献量(篇)
6200
总下载数(次)
30
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