拟南芥4-香豆酰-CoA连接酶基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘钦松 吴永坤 张念强 石党委 祁庆生 翟逸
• 来源期刊: 生物化工
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥 4-香豆酰-CoA连接酶 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-4,8
• 页数: 5页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 2198字
• 语种: 中文

摘要

以拟南芥总RNA为模板,利用RT-PCR的方法从拟南芥中扩增获得一条4-香豆酰-CoA连接酶基因完整的cDNA序列,命名为4CL1.利用生物信息学生物软件对其核酸和蛋白质序列进行分析,结果表明,该序列长1686bp,与已报道的拟南芥4-香豆酰-CoA连接酶基因的序列相似性达到98%~100%,氨基酸序列相似性为99%~100%;4CL1基因编码561个氨基酸,该氨基酸序列具有典型的4-香豆酰-CoA连接酶AMP-binding保守结构域LPYSSGTTGLPK,同时含有该蛋白家族的催化活性中心GEICIRG序列;预测的分子量为61.05kDa,理论等电点为5.25,不稳定参数为35.93,在分类上属于稳定性蛋白;二级结构主要以无规则蜷曲、α-螺旋、延伸链及β转角为主,其含量分别为34.22%、30.30%、24.06%和11.41%.