鸭输卵管壳腺部参与绿壳蛋性状形成的miRNAs富集与分析

• 作者: 刘贺贺 张涛 王继文 甘心梦 罗俊 胡继伟 谢艾轩
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 绿壳蛋 鸭壳腺部 miRNAs 高通量测序技术 胆绿素
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 133-141
• 分类号: S834+.83
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.01.016

摘要

禽类绿壳蛋性状不仅有躲避捕食的作用,还是禽类的一个重要经济性状,由于进化和遗传背景差异,不同禽类的绿壳蛋性状形成机制不同.本研究以绿壳蛋鸭(Anas platyrhynchos)和白壳蛋鸭输卵管壳腺部组织为研究对象,基于高通量测序技术,富集和分析参与绿壳蛋性状形成的小RNA(microRNAs,miRNAs)及其靶基因.结果显示,在绿壳蛋鸭和白壳蛋鸭壳腺部共预测到269个miRNAs,其中已知的miRNAs 245个,新预测的miRNAs 24个;相对于白壳蛋鸭,绿壳蛋鸭壳腺部存在169个差异miRNAs,包括85个上调的miRNAs,84个下调的miRNAs,共预测获得4 872个靶基因.样本间miRNAs表达量分析发现,各样品之间相关性均较高.富集基因本体(Top Gene Ontology,TopGO)分析结果显示,存在参与血红素结合的分子功能(富集基因23个,P=O.008),并且大部分均伴有电子和Fe2+的转运功能.另外,ggamiR-133b、gga-miR-193b-3p和gga-miR-449a(log2(差异倍数(fold change,FC)＞2)＞1,P＞0.05)预测到了参与胆绿素合成的血红素加氧酶1基因(heme oxygenase 1,HMOX1)和大量的有机物转运代谢基因.以上结果提示,部分miRNAs可能参与了鸭绿壳蛋性状的形成调控,但可能不是影响鸭绿壳蛋形成的主要因素.研究结果为揭示家禽绿壳蛋的形成分子机制提供了理论依据,为基于基因操作技术培育绿壳蛋禽类提供了基础资料.