猪基因共表达网络模块的构建及功能分析

• 作者: 张婷婷 马磊 魏凯
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 基因共表达网络模块 功能协同性 组织特异性 猪
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 2205-2215
• 页数: 11页
• 分类号: S828.2
• 字数: 6345字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2017.11.023

摘要

旨在构建猪(Sus scrofa)的基因共表达网络模块,挖掘功能基因.基于权重基因共表达网络分析技术(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),利用猪的多组织转录组测序数据,构建了24个猪的基因共表达模块,并对模块进行生物学过程、KEGG通路、疾病和组织特异性分析.结果显示,模块具有功能特异性,与器官的发育阶段、代谢通路有关,且同一模块中的信号通路间呈现调控关系;模块可富集与代谢、神经系统、癌症相关的疾病基因;模块可定位于特定组织.分析发现,钙调通路、PI3K Akt通路、MAPK通路、泛素介导通路等在模块中呈现关键作用,催产素通路、昼夜节律通路内的相关基因对繁殖调控具有重要作用,SIX1、PRKAG3等基因的局部网络涉及肌肉发育.综上表明,在基因组水平上,构建和分析基因表达调控网络,可为探究中国地方猪品种特有的基因资源信息、丰富分子育种理论,提供新思路和新途径.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马磊	石河子大学生命科学学院	24	73	3.0	7.0
2	张婷婷	石河子大学生命科学学院	23	39	3.0	4.0
3	魏凯	石河子大学生命科学学院	2	4	2.0	2.0