保育猪舍不同粒径悬浮颗粒物细菌群落组成的初步研究

• 作者: 朱术会 李丛丛 郭洪梅 鞠雷
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 保育猪舍 悬浮颗粒物 细菌群落组成 高通量测序
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 基础兽医
• 页码范围: 2198-2204
• 页数: 7页
• 分类号: S851.24
• 字数: 4810字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2017.11.022

摘要

通过高通量测序技术,初步研究保育猪舍不同粒径悬浮颗粒物细菌群落的组成.利用Andersen-6级撞击式空气微生物样品收集器,以5％的公绵羊血-琼脂培养基为采样介质收集保育猪舍气溶胶微生物,培养24 h后提取总DNA,扩增16S rDNA的V3-V4区,进一步采用Illumina MiSeq高通量测序研究保育猪舍不同粒径悬浮颗粒物细菌群落组成.各级采样样品共获得高质量序列301 065条,按照序列相似度97％的标准对高质量序列进行OTU的划分,得到2 104个OUT;通过α多样性分析,菌群丰富度由大及小依次为3_4s、3_2s、3_1s、3_6s、3_5s、3_3s,通过不同分析指数菌群多样性略有差异,但是多样性最高的为3_2s、3_5s,最低的为3_3s;菌落组成分析来看,细菌主要来自4个门、40个菌属,其中丰度最高的是变形菌门、厚壁菌门,总比例较高的菌属为变形菌门的不动杆菌属和丛毛单胞菌属,放线菌门的葡萄球菌属以及拟杆菌门的类香味菌属;利用UniFrac的PCoA分析3_1s、3_5s、3_4s、3_2s菌群相似度较高;3_6s、3_3s与其余样品菌群结构差异明显.可见,2.1～3.3 μm粒径悬浮颗粒细菌菌群丰富度最高,有14个菌属的细菌被报道对人和动物具有致病性,且各层级群落结构存在差异,相邻层级差别较大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱术会		6	2	1.0	1.0
2	郭洪梅		24	35	3.0	5.0
3	鞠雷		8	23	3.0	4.0
4	李丛丛		2	1	1.0	1.0