猪流行性腹泻病毒山西分离株ORF3基因序列分析

• 作者: 刘文俊 吴忻 姚敬明 孟帆 李红丽 樊振华 王娟萍 米瑞娟 薛翼鹏 赵岳 韩一超
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻 山西分离株 ORF3基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 页码范围: 103-106
• 页数: 4页
• 分类号: S852.65|S432.4
• 字数: 2565字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2017.04.017

摘要

为了研究山西地区猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传变异情况,2014-2015年从山西地区11个地市收集的PEDV阳性病料中扩增到4株PEDV 的ORF3基因,并进行序列比对及遗传分析.序列分析结果表明,4株PEDV 山西分离毒株的ORF3基因与CV777毒株相比,无核苷酸插入和缺失,有部分核苷酸及氨基酸发生变异;4株PEDV 山西分离毒株的ORF3基因之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为99.6%~100.0%和98.7%~99.6%,与CV777、疫苗株CV777 truncated和attenuated DR13核苷酸同源性分别为96.6%~97.0%,90.6%,97.6%~98.1%,氨基酸同源性分别为95.1%~96.0%,88.0%,97.1%~98.1%.遗传进化分析结果显示,4株PEDV 山西分离毒株与12株2010-2015年我国各地方分离的毒株和2009年分离的CH/JL/09毒株亲缘关系较近;与CV777、LZC、Brl/87和2个疫苗株(CV777truncated和attenuated DR13)亲缘关系较远.