乙型肝炎、丙型肝炎病毒相关性肝癌基因差异表达的生物信息学分析

• 作者: 冯勇 李文静 秦健 陈朗
• 来源期刊: 武汉大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学 基因富集分析 乙肝病毒 丙肝病毒 肝癌
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 临床医学研究
• 页码范围: 604-609
• 页数: 6页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.14188/j.1671-8852.2017.04.020

摘要

目的:筛选乙型肝炎病毒(HBV)与丙型肝炎病毒(HCV)相关性肝癌的差异表达基因,探讨其基因功能富集的差异,促进对HBV、HCV相关性肝癌致病机理的了解.方法:从公共基因芯片数据库中下载数据集GSE44074,利用在线软件GEO2R筛选HBV相关性肝癌与HCV相关性肝癌间的差异表达基因,利用DAVID数据库、基因集富集分析(GSEA)方法等分析预测HBV、HCV相关性肝癌的基因功能富集的差异.结果:利用数据集GSE44074共筛选出34个差异表达基因(矫正后P＜0.05).HBV相关肝癌样本中高表达的基因与多细胞组织加工和生物学过程负向调控有关.HCV相关肝癌组中线粒体呼吸链、细胞器膜蛋白及线粒体膜功能等基因功能集存在显著上调.结论:HBV、HCV相关性肝癌样本间存在多个差异表达基因及差异基因功能富集.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦健	武汉大学人民医院中心实验室	4	29	3.0	4.0
2	冯勇	武汉大学医学微生物学教研室	10	12	2.0	3.0
3	陈朗	武汉大学基础医学院免疫系	10	12	2.0	3.0
4	李文静	武汉大学基础医学院免疫系	5	42	2.0	5.0