野生蕉ω-3脂肪酸去饱和酶基因FAD7密码子偏性分析

• 作者: 林玉玲 赖志宸
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 野生蕉 密码子偏性 ω-3脂肪酸去饱和酶 聚类分析
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 503-507
• 页数: 5页
• 分类号: S668.1
• 字数: 3381字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.05.008

摘要

为了解FAD7的密码子使用特性,试验采用CodonW、SPSS19.0、MEGA5.0等软件和EMBOSS在线程序对野生蕉FAD7密码子偏性进行分析,同时与其他单/双子叶植物FAD7和模式生物基因组进行比较.结果显示,野生蕉FAD7密码子偏性水平较弱,密码子组成和结尾偏好使用G或C,而CUC、CAG和AGG等在该基因中具有较高的使用频率;物种间FAD7比较结果发现,单子叶植物FAD7密码子组成明显偏好G或C,而双子叶植物则完全相反;基于密码子使用频率FAD7聚类结果与CDS分类结果一致,均能将单/双子叶植物区分开来;此外,大肠杆菌原核表达受体系统可作为野生蕉FAD7基因异源表达理想试验体系.研究结果为野生蕉FAD7后续结构和功能研究提供了科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林玉玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	148	560	10.0	16.0
2	赖志宸	电子科技大学计算机科学与工程学院	1	2	1.0	1.0