基于等质量肽段末端标记策略的质谱鉴定新算法

• 作者: 单亦初 张玉奎 邓玉林 郑乃仁
• 来源期刊: 分析化学
• 关键词: 蛋白质组学 等重标记 蛋白质鉴定
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1441-1447
• 页数: 7页
• 字数: 5921字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11895/j.issn.0253-3820.170250

摘要

等质量肽段末端标记(Isobaric peptide termini labeling,IPTL)是一种使用轻、重同位素分别对肽段的C端和N端进行等重标记的技术.在对使用这种标记技术得到的数据进行一级谱分析时,由于肽段的质量相同,不会增加样本的复杂性,而在处理二级谱的数据时,可利用成对的b、y离子进行分析.本研究利用IPTL方法得到的实验数据设计了一种新的打分算法:全部离子打分算法(All ions scoring algorithm,AISA).AISA在对数据进行处理时,可以同时得到定性和定量信息.在Q-Exactive HeLa和Human-HCC-HL数据集上的蛋白定量覆盖率分别达到99%和100%.在Q-Exactive HeLa 2D RPLC数据集上,AISA算法鉴定到的PSM、唯一肽段和蛋白质分别比Morpheus高15%、26%和22%.在Human-HCC-HL数据集上,AISA算法鉴定到的PSM、唯一肽段和蛋白质分别比Morpheus高24%、39%和27%.在Q-Exactive HeLa和Human-HCC-HL数据集上蛋白质定量比值的平均值非常接近1,分别为1.18和0.90;在0.5~2.0区间内的定量比值分别为91%和94%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓玉林	北京理工大学生命学院	192	865	13.0	20.0
2	单亦初	中国科学院大连化学物理研究所	11	59	5.0	7.0
3	张玉奎	北京理工大学生命学院	154	1375	20.0	30.0
7	郑乃仁	北京理工大学生命学院	2	1	1.0	1.0