苹果抗寒矮化砧应答冷胁迫的转录因子基因鉴定

• 作者: 何平 常源升 李林光 王海波 程来亮
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 苹果 抗寒矮化砧 冷胁迫 转录因子
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1468-1478
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13592/j.cnki.ppj.2016.0494

摘要

利用RNA-seq鉴定抗寒苹果矮化砧木'71-3-150'冷胁迫(4°C)响应过程中的转录因子.结果表明:该砧木冷胁迫2、6、12和24 h时的样品与未处理相比,差异表达的转录因子基因数分别为83、98、115和136,共计228个,表明大量转录因子参与该砧木的冷胁迫响应.这些转录因子基因属于32个家族,占苹果转录因子总数的7.25％,包括32个WRKY、30个AP2/ERF、28个bHLH、21个MYB、13个NAC、12个HSF、10个CO-like、9个MYB_related、8个TCP、6个bZIP、6个C2H2、6个C3H、6个GATA、5个G2-like、4个GRAS、4个HD-ZIP、4个NF-YC、4个ARF、3个Dof、3个Trihelix、2个GRF和2个NF-YB,以及B3、DBB、E2F/DP、EIL、MIKC、M-type、SBP、TALE、YABBY和ZF-HD家族的各1个成员,其中有8个在苹果参考基因组没有注释.这些基因总体上分为10类表达模式,同一类表达模式中的基因均涉及到多个转录因子家族,表明转录调控在该砧木应答冷胁迫中存在复杂机制.根据对鉴定到转录因子基因的功能分析,它们参与了冷适应相关功能基因和生长发育相关功能基因的表达调控,使该砧木在冷胁迫下重建体内物质代谢和氧化还原平衡,获得抗寒性,并且重建适应冷胁迫的新的生长与发育平衡.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李林光		142	574	12.0	17.0
2	王海波		61	234	8.0	12.0
3	何平		43	120	6.0	8.0
4	常源升		27	82	6.0	8.0
5	程来亮		15	73	6.0	7.0