基于线粒体细胞色素氧化酶b(cytb)全基因序列分析我国部分地区兔痒螨的遗传变异特征

• 作者: 古小彬 杨光友 王保健 简克灵 赖为民 赵习彬
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中国 兔痒螨 cytb基因 遗传变异
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 714-721
• 页数: 8页
• 分类号: S852.746
• 字数: 5228字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2017.04.015

摘要

为探讨兔痒螨是否会受兔品种、温度带和地域来源的不同而出现遗传变异,采用PCR技术首次对我国6个省份共68个獭兔来源(陕西、河北、河南和湖北)和肉兔来源(山东和四川)痒螨虫株的线粒体细胞色素氧化酶b(cytb)基因全序列进行扩增,经测序后分析遗传变异情况.68条兔痒螨cytb全序列均为1 100 bp,共有96个(8.7％)变异位点和46个单倍型;我国整体种群的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.959 2和0.012 0,具有较高的遗传多样性;我国兔痒螨整体种群的中性检验结果为负值(Tajima's D=0.444 01,Fu’sFs=-1.454 25),且呈现多峰的错配分布曲线现象,暗示我国兔痒螨可能经历过突增长过程;我国所有种群间存在一定的遗传分化(Fst=0.262 2)、基因流水平较低(Nm=0.7);分子方差(AMOVA)分析表明遗传分化主要发生在种群内;单倍型网络图和NJ树显示我国兔痒螨的聚类与兔品种、温度带和地理来源无关.结果表明,我国6个地区的兔痒螨虫株呈现较高的遗传多样性,具有一定的遗传分化,但未形成以兔品种、温度带和地理分布为格局的遗传结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨光友	四川农业大学动物医学院	167	889	15.0	19.0
2	古小彬	四川农业大学动物医学院	55	257	8.0	13.0
3	赖为民	四川农业大学动物医学院	21	59	5.0	6.0
4	简克灵	四川农业大学动物医学院	3	8	2.0	2.0
5	王保健	四川农业大学动物医学院	4	15	3.0	3.0
6	赵习彬	四川农业大学动物医学院	4	9	2.0	3.0