番茄KNOX基因家族鉴定及茄科作物KNOX基因进化关系分析

• 作者: 叶曙光 宰文珊 张海利 熊自力 马彦如
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 番茄 KNOX基因家族 基因结构 表达分析 进化
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1263-1271
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2017.07.1263

摘要

为了探明番茄KNOX基因家族特征及茄科作物中KNOX的进化关系,利用生物信息学方法,在全基因组水平上对番茄及其它茄科作物KNOX基因家族成员进行鉴定和分析.结果表明,番茄基因组中共含有8个KNOX基因(SlKNOX1～SlKNOX8),分别分布在番茄8条染色体上;多序列比对发现,除SlKNOX5外,所有基因均含有同源异型盒蛋白特有的4种结构域,即KNOX1、KNOX2、ELK和Homeobox KN.利用系统发育树将茄科作物KNOX基因分为2类:Class Ⅰ和ClassⅡ.茄科作物KNOX基因与拟南芥同源基因可能经历了不同的进化历程,在茄科作物中,特有的进化分支(Class Ⅰ C)已经出现.qRT-PCR分析发现,番茄SlKNOX1在花蕾和花中具有较高表达,在果实生长发育过程中表达量逐渐降低,SlKNOX2～ SlKNOX4在果实生长发育过程中几乎不表达,SlKNOX6和SlKNOX7在所测组织中均有表达,SlKNOX8在果实成熟过程中表达量逐渐增加,且在根中表达量最大.本研究在全基因组水平上揭示了番茄中KNOX基因家族特征以及茄科作物中KNOX基因的系统发育关系,为进一步揭示KNOX基因家族在番茄组织器官中的功能及进化模式奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张海利		32	57	4.0	6.0
3	宰文珊		19	59	3.0	7.0
7	叶曙光		7	13	2.0	3.0
11	熊自力		3	8	1.0	2.0
17	马彦如		4	9	1.0	3.0