霍山石斛PMM基因的克隆及其表达分析

• 作者: 叶秀仙 林榕燕 钟淮钦 黄敏玲
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 霍山石斛 PMM基因 克隆 qPCR
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 2326-2333
• 页数: 8页
• 分类号: S682.31
• 字数: 5192字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2017.12.020

摘要

为研究磷酸甘露糖变位酶基因(PMM)的功能及其在多糖生物合成中的表达调控机制,以霍山石斛原球茎为材料,利用RT-PCR技术,克隆PMM基因,对其cDNA序列和表达情况进行分析.结果显示:霍山石斛PMM基因cDNA序列长949 bp,包含一个747 bp的开放阅读框,共编码248个氨基酸,GenBank中的登录号为KY912084.生物信息学分析表明:该蛋白属于HAD超家族,可能是一种稳定的、不具有信号肽和跨膜结构的亲水蛋白.系统进化树分析表明,霍山石斛PMM与铁皮石斛、海枣、油棕、芦笋亲缘关系较近,处于同一分支.qPCR结果显示:PMM基因在茎中的相对表达量最高;在4种不同药用石斛比较中,鼓槌石斛的相对表达量最高,霍山石斛的表达量最低.本研究结果表明PMM基因可能不仅参与到石斛多糖的合成,还与其它化合物的生物合成相关.