三角褐指藻pds基因生物信息学与诱导表达分析

• 作者: 严小军 俞凯 朱帅旗 王何瑜 章丽 陈俊粤 龚一富
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 三角褐指藻 八氢番茄红素脱氢酶 岩藻黄素 生物信息学 诱导表达
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 2306-2313
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2017.12.2306

摘要

岩藻黄素是一类具有重要药用价值和开发价值的新型海洋药物,八氢番茄红素脱氢酶(PDS)是三角褐指藻类岩藻黄素生物合成途径中的一个重要的限速酶.为了更好地开发和利用岩藻黄素,通过RT-PCR克隆了三角褐指藻pds基因(Ptpds,GenBank序号:XM_002184476.1)cDNA全长序列,并从基因层面分析了外源诱导子对岩藻黄素生物合成的诱导机制,进一步探究Ptpds的结构和表达特性.结果表明,Ptpds基因cDNA全长2 442 bp,开放阅读框(ORF)为1 773 bp,编码589个氨基酸,并含有一个NAD(P)-binding结构域;蛋白分子结构预测结果表明,三角褐指藻PDS蛋白(PtPDS)分子呈亲水性,含有转运肽、信号肽、跨膜结构域等结构.系统进化树分析显示,PtPDS与新型微藻的PDS蛋白亲缘关系较近,且在所选取的藻类中进化地位较为原始.诱导表达结果表明,MeJA、ASA、AA、ACS等4种诱导子均能促进Ptpds基因的表达,且在4种诱导子处理下,三角褐指藻中的岩藻黄素含量变化与Ptpds基因的表达水平变化呈现高度的一致性,说明Ptpds基因是MeJA、ASA、AA、ACS等诱导子促进三角褐指藻岩藻黄素的生物积累的关键酶基因之一 本研究结果为探究藻类岩藻黄素合成机理提供了依据,并为利用代谢工程手段提高岩藻黄素含量奠定了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	严小军	宁波大学海洋学院	235	1827	21.0	28.0
2	龚一富	宁波大学海洋学院	54	342	11.0	16.0
3	朱帅旗	宁波大学海洋学院	17	79	4.0	8.0
4	王何瑜	宁波大学海洋学院	29	117	5.0	9.0
5	俞凯	宁波大学海洋学院	12	35	3.0	5.0
6	章丽	宁波大学海洋学院	13	82	4.0	9.0
7	陈俊粤	宁波大学海洋学院	2	6	2.0	2.0