辣椒GRAS家族全基因组鉴定与表达分析

• 作者: 尚庆茂 张焕欣 董春娟
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 GRAS基因家族 进化分析 表达特性
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 2305-2317
• 页数: 13页
• 分类号: S641.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0132

摘要

基于辣椒全基因组数据信息,利用生物信息学方法对CaGRAS基因家族进行了系统鉴定和进化分析,并通过Real-time PCR方法检测了CaGRAS家族组织表达模式和对PEG6000、盐胁迫的应答.结果表明:在辣椒中存在54个CaGRAS基因,除11号染色体外其余染色体均有分布,外显子数1～3,等电点4.97～9.13;系统进化分析显示CaGRAS基因可分为8个进化群;CaGRAS基因具有不同的表达模式,在根、茎、叶片和茎尖中优势表达的基因分别有34、8、3和8个;多数CaGRAS基因能响应PEG6000和盐胁迫,其中CaGRAS11、CaGRAS30、CaGRAS40、CaGRAS44和CaGRAS50受到PEG6000和盐胁迫的强烈诱导.本研究为深入解析CaGRAS家族基因的功能奠定了一定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尚庆茂	中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室	109	1937	26.0	40.0
2	董春娟	中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室	29	292	9.0	16.0
3	张焕欣	中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室	4	22	3.0	4.0